То есть все мыши в одной клетке были и могли перезаражать друг друга инфекцией, или один доминантный самец влиял на жизнь всех остальных мышей??

По-моему, это ужасающе безграмотная постановка опыта, это вижу даже я, который никогда не занимался биологией!

Нужна намного более корректная постановка опыта, если, конечно, нет желания получить изначально ожидаемый результат.
Например: одна комната отводится для эксперимента, другая для хранения всех клеток. В комнату для эксперимента вносятся две клетки, в каждой одна мышь одного пола. На клетках номер и буквы "1-А", "1-Б". Сенс записывает у себя номер и букву на клетке, на которую он пытался воздействовать. Затем лаборант уносит эти клетки в комнату для хранения. Затем заносит следующую пару клеток в комнату для эксперимента, и так далее. Затем эксперимент заканчивается, и в комнату в отдельных клетках добавляют еще контрольную группу мышей, на которую заведомо не было воздействия, для чистоты эксперимента помеченных такими же номерами и буквами, как и остальные клетки. Для меня очевидно, что нужно изолировать мышей друг от друга, чтобы они не чувствовали звуков и запахов друг друга, заведомо не знали, что кто-то из них сдох, чтобы это не влияло на уровень стресса. Грамотные биологи наверняка умеют делать такие корректные эксперименты.
Затем кормят мышей и наблюдают за ним, пока те не передохнут.